Como toda a Alemanha, teve uma pausa nas suas atividades em virtude da guerra, mas o diferencial veio a seguir. Após a guerra, houve a divisão entre Alemanhas Ocidental e Oriental e, sendo o Lauter um clube da porção leste alemã, viriam então participar do campeonato da Alemanha Oriental.
No ano de 1950, houve outra mudança: o clube passou a jogar sob o nome BSG Freiheit Wismut. Na temporada seguinte, nova mudança para BSC Empor Lauter, troca essa que deu fôlego para o time ingressar na Liga da Alemanha Oriental em 1952. O time, no entanto, não teve um bom desempenho e, após uma decisão política dos diretores houve mais uma mudança de denominação, dessa vez para SC Empor Rostock.
O Hansa Rostock então foi formado em 1965, quando o departamento de futebol decidiu tornar-se independente dos outros esportes, passando a ser um clube apenas de futebol. Tal mudança fez a agremiação ser mais focada em seus objetivos, resultando num sucesso maior dentro da Alemanha Oriental.
Contraditoriamente, esse sucesso durou pouco e, sem investimentos mais profundos, o clube passou a desempenhar um mau futebol, chegando até a cair para a segunda divisão.
Nos anos 1980, o Hansa voltou à primeira divisão, mas sem muito brilho, e quando houve a reunificação das Alemanhas, em 1991, o time venceu o seu primeiro campeonato nacional (ainda da Alemanha Oriental).
Com o país unido novamente, o Hansa voltou a figurar nas partes mais baixas da tabela, caindo para a segunda divisão e subindo para a primeira constantemente nos últimos anos. Ainda assim, o clube contou com jogadores de sucesso no país inteiro: Oliver Neuville, Stefan Beinlich, Carsten Jancker, Marko Rehmer e outros estrangeiros, como o nigeriano Victor Agali, o finlandês Jari Litmanen, os suecos Andreas Jakobsson e Markus Allback, o bósnio Sergej Barbarez, e outros.
O clube não foi bem na temporada 2007/2008 e acabou sendo rebaixado. Na temporada 2008/2009 o Hansa Rostock disputará a segunda divisão do Campeonato Alemão. Rebaixado novamente, está na 3. Fußball-Liga
Estádio
DKB Arena, Rostock – 30 mil pessoas
Títulos
Campeonato da Alemanha Oriental 1991
Copa Da Alemanha Oriental 1991
Hino
Wer hat die schnellsten und die allerschönsten Fußballbeine?
FC Hansa Ohohoh
Wen hätte manche Frau so gerne ganz für sich alleine?
FC Hansa Ohohoh
Wer schießt die Bälle wie Raketen sicher rein ins Tor?
FC Hansa Ohohoh
Wer lässt die Gegner beten wenn die Fans singen im Chor:
FC Hansa du bist so genial
FC Hansa wir lieben dich total
auch wenn du mal danebenschießt, wir sind für dich da
FC Hansa, FC Hansa
Wer hat den schönsten Fußballpräsidenten auf der Welt?
FC Hansa Ohohoh
Wer hat den besten Torwart, der die Bälle alle hält?
FC Hansa Ohohoh
Wer hat die besten Fans, die rufen laut bei jedem Tor?
FC Hansa Ohohoh
FC Hansa du bist so genial
FC Hansa wir lieben dich total
auch wenn du mal danebenschießt, wir sind für dich da
FC Hansa, FC Hansa
FC Hansa du bist so genial
FC Hansa wir lieben dich total
auch wenn du mal danebenschießt, wir sind für dich da
FC Hansa, FC Hansa
FC Hansa Ohohoh
FC Hansa Ohohoh
FC Hansa Ohohoh
FC Hansa Ohohoh
FC Hansa Ohohoh
FC Hansa Ohohoh
Site
http://www.fc-hansa.de/