A primeira participação numa prova oficial aconteceu na temporada 1939/40 com a presença no Campeonato Concelhio de Guimarães, que viria a vencer. Qualificou-se então para os campeonatos distritais, onde também se sagrou campeão.
Em 1941/42, o Moreirense disputou o campeonato da II Divisão da Associação de Futebol de Braga, que venceu, tal como fez na época seguinte.
No entanto, entre 1943 e 1970, o clube, apesar de continuar filiado na AF Braga, não disputou provas oficiais devido a dificuldades financeiras, que surgiram com o início da Segunda Guerra Mundial. Apenas realizou jogos particulares. Durante este período o Moreirense não tinha um recinto de jogos próprio e teve de se socorrer de terrenos emprestados, desde escolas a campos de cultivo.
Em 1970, graças ao esforço feito por pessoas de Moreira de Cónegos, foi inaugurado um recinto de jogos, que viria a ser substituído, em 1974, pelo Parque Desportivo Comendador Joaquim de Almeida Freitas, que ainda hoje é utilizado.
O Moreirense regressou às competições em 1970/71, alinhando na II Divisão da AF Braga. Aos poucos a equipa foi subindo de escalão, até que na época 1984/85 se sagrou vice-campeã da Série A da III Divisão Nacional, o mesmo sucedendo em 1986/87. Finalmente, em 87/88 triunfou na sua série e ascendeu à II Divisão B.
Em 1994/1995, o Moreirense sagrou-se campeão da II Divisão B e ascendeu à II Divisão de Honra, onde se manteve até ao ano 2000.
Em 2000/2001, o Moreirense venceu de novo o campeonato da II B e subiu à II Liga, da qual se sagrou campeão logo em 2001/2002, numa altura em que era treinado por Manuel Machado. Foi com este treinador, oriundo do Vitória de Guimarães, de onde trouxe vários jogadores jovens para Moreira de Cónegos, que o Moreirense se estreou na I Liga em 2002/2003, ficando na 12.ª posição.
Nestas últimas épocas, o Moreirense registou a 1ª participação na 2ª Liga, e após uma queda na 2ª Divisão B, alcançou duas subidas consecutivas, que permitiram ao clube subir ao escalão principal, e manter-se por lá durante três épocas, tendo registado com melhor classificação, um 9º lugar, sucesso ao qual esteve ligado o treinador Manuel Machado. Aí, o Moreirense registou duas descidas consecutivas, estando actualmente a militar na 2ª Divisão B.
Estádio
Parque Desportivo Comendador Joaquim de Almeida foi remodelado e reinaugurado a 20 de Outubro de 2002, contando com uma lotação para 6000 espectadores.
Títulos
Campeão Nacional da 2ª Divisão B (1994-1995; 2000-2001)Campeão Nacional da 2ª Liga (2001-2002)
Hino
O verde da esperançaA quem pertence, a quem pertence
Ao Moreirense, ao Moreirense
O branco da pureza
A quem pertence, a quem pertence
Ao Moreirense, ao Moreirense
Em 1938, em Novembro dia 1
Nasceu o pequeno Moreirense
Que igual não há nenhum
Nasceu pequenino mas valente
Pelo bem e contra o mal
Ganhou asas, voou alto e foi em frente
Hoje é grande em Portugal
Também fazes nossa Vila conhecida
Quando perdes ou quando vences
Em todos os momentos desportivos da tua vida
Somos sempre Moreirense
O verde da esperança
A quem pertence, a quem pertence
Ao Moreirense, ao Moreirense
O branco da pureza
A quem pertence, a quem pertence
Ao Moreirense, ao Moreirense
Em 1938, em Novembro dia 1
Nasceu o pequeno Moreirense
Que igual não há nenhum
Nasceu pequenino mas valente
Pelo bem e contra o mal
Ganhou asas, voou alto e foi em frente
Hoje é grande em Portugal
Também fazes nossa Vila conhecida
Quando perdes ou quando vences
Em todos os momentos desportivos da tua vida
Somos sempre Moreirense
O verde da esperança
A quem pertence, a quem pertence
Ao Moreirense, ao Moreirense
O branco da pureza
A quem pertence, a quem pertence
Ao Moreirense, ao Moreirense
Refrão (x6)
Site
http://www.moreirensefc.pt/