Fundado em 2006, o clube foi criado a partir de uma dissidência do Juazeiro Social Clube e por necessidade de uma segunda equipe que representasse a sociedade Juazeirense.
A Juazeirense foi fundada em 12 de dezembro de 2006 pelo deputado Roberto Carlos após o mesmo perder a eleição de presidente do Juazeiro Social Clube para Eládio Rocha. O clube estreou no Campeonato Baiano da Segunda Divisão no ano de 2008. Em sua primeira partida oficial empatou em 0 a 0 com o Sport Clube Camaçariense atuando em Juazeiro. O clube obteve classificação para a fase semi-final da competição, porém foi eliminado pelo Guanambi Atlético Clube após derrota em casa por 1 a 0 e empate como visitante em 0 a 0. Em 2009 conseguiu chegar mais longe, alcançou a final da competição após vingar-se do Guanambi Atlético Clube ao derrotá-lo na mesma mesma fase semi-final que ano passado lhe custou a eliminação, vitória em casa por 2 a 0 e nova vitória em Guanambi por 2 a 1. Na final porém foi derrotado pela Associação Desportiva Bahia de Feira, empate em casa em 1 a 1 e novo empate em Feira de Santana, desta vez em 2 a 2, com a melhor campanha a Associação Desportiva Bahia de Feira obteve o título e o acesso. Em 2010 o elenco foi fortalecido e o clube dentro de campo conquistou pontos suficientes para classificar para a semifinal, porém devido a escalação de um atleta irregular na vitória por 2 a 1 contra o Sport Clube Camaçariense a Juazeirense foi punida em seis pontos e acabou eliminada ao empatar em casa em 0 a 0 contra a Catuense Futebol S/A em jogo que necessitava vencer. O sonhado acesse veio em 2011 quando o clube passou para a semi-final ao derrotar na última rodada o Galícia Esporte Clube em casa por 2 a 0, na fase seguinte passou com facilidade pela Associação Desportiva Jequié derrotando-a como visitante por 2 a 1 e em casa por 3 a 1, como subiam dois clubes a Juazeirense enfim obteve o acesso a Primeira Divisão. Na final da competição obteve o título com uma derrota como visitante para o Itabuna Esporte Clube por 2 a 0 e vitória em casa pelo mesmo placar
A equipe ganhou o apelido de “Cancão de Fogo”, ave valente que vive na catinga.
O Juazeirense tem como rival, o Juazeiro, time da mesma cidade. O primeiro confronto das equipes aconteceu no dia 31 de maio de 2009 com uma vitória do Juazeirense por 1 a 0 e o segundo confronto com vitória da Sociedade Desportiva Juazeirense, com 2 x 1.
Título : Campeonato Baiano - 2ª Divisão 2011
Estádio : O Estádio Adauto Moraes, apelidado de Adautão é um estádio de futebol localizado na cidade de Juazeiro, estado da Bahia, ele pertence a prefeitura de Juazeiro e atende aoJuazeiro Social Club e à Sociedade Desportiva Juazeirense. Sua capacidade é de 8.000 pessoas