O São Luiz profissionalizou-se na década de 50, quando passou a disputar a Segunda Divisão gaúcha. Nos anos 70, o clube esteve em Montevidéu, participando da Copa Atlântico de Futebol. Depois de 15 anos, voltou a primeira divisão estadual em 1991. Conquistou, em 1998, a Copa Galego, derrotando o Glória de Vacaria na final.
Durante a preparação para a Copa do Mundo de 1994, no qual a Seleção Brasileira se sagrou campeã, o São Luiz, enfrentou em 1991 a futura campeã mundial, no Estádio Beira-Rio, em Porto Alegre, empatando em 0 a 0. A escalação do São Luiz nese jogo foi: Janio, Polaco, Caçula, Newmar, Kiko, João Luiz, Negrine, Betinho, Marco Antônio, Café e Edmundo. Técnico: Cassiá.
Em 2002, depois de quase fechar o departamento de futebol profissional e de acumular dívidas, o São Luiz de Ijuí mudou de direção, investiu em contratações e modificou completamente o time. O time permaneceu fechado por nove meses e o clube esteve ameaçado de falir. A nova direção assumiu em dezembro e, com a ajuda da comunidade, montou a equipe para o Campeonato Gaúcho de 2002. Poletto treinou o São Luiz pela terceira vez. Entre as contratações, Paulo Gaúcho, então com 39 anos, que no Campeonato Gaúcho de 1994 se consagrou o segundo maior artilheiro da história do torneio, com 24 gols. Time-base: Luciano; Luciano Panambi, Carlão, Jarbas e Martins; Paulo Roberto, Ludo, André Cemin e Paulo Gaúcho; Marcio Galvão e Alessandro.
Atualmente, o Esporte Clube São Luiz encontra-se na Primeira Divisão do futebol gaúcho.
Títulos
Campeonato Gaúcho - 2ª Divisão: 3 vezes (1975, 1990 e 2005).
Estádio
O São Luiz, tem como seu principal patrimônio o ESTÁDIO 19 DE OUTUBRO, com capacidade para 8.000 pessoas, sendo boa parte sentados, copas (alimentação), vestiários, sala de impressa, salas de transmissão de imprensa, alojamento de atletas e sede do clube.
O estádio possui iluminação, permitindo a realização de partidas à noite e destaca-se pela sempre ótima conservação do gramado.
O Estádio 19 de outubro localiza-se em um ponto privilegiado da cidade, sendo de total e fácil acesso.
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