A Associação Desportiva Atlanta foi fundada em em 1º de Fevereiro de 1983 e conquistou o título da 2ª Divisão do Campeonato Baiano em 1987 chegando a 1ª Divisão no ano seguinte. Na elite baiana o Atlanta estreou no dia 28 de fevereiro sendo derrotado em casa pela Catuense Futebol S/A por 2 a 1. Aquela derrota foi uma prévia da má campanha do Atlanta, no primeiro turno foi apenas um ponto em cinco jogos, no segundo turno foram dois pontos em quatro partidas, no terceiro turno sua melhor participação marcando seis pontos em cinco partidas chegando ao Quadrangular Final do turno. No Quadrangular Final a equipe perdeu as três partidas: 5 a 0 para o Esporte Clube Bahia, 7 a 2 para o Fluminense de Feira e 1 a 0 para a Catuense Futebol S/A. Abalado, no quarto turno perdeu as quatro partidas que disputou e foi rebaixado para a 2ª Divisão.
Após o rebaixamento o Atlanta disputou a 2ª Divisão até o ano de 1992, em 1993 abandonou o profissionalismo até 2000 quando retornou na 3ª Divisão sem conseguir bons resultados. Em 2008 apoiado pela empresa Doce Mel voltou ao futebol profissional na 2ª Divisão, mas devido a um tropeço no último jogo contra o Cruzeiro que era lanterna, estava eliminado e com dois atletas a menos em campo conseguiu chegar ao empate com o Atlanta com um gol no último minuto de jogo, ficou de fora da fase semi-final. Após um ano sabático o Atlanta retornou as atividades em 2010 para disputar a 2ª Divisão novamente com o apoio da Doce Mel da cidade de Ipiaú que exigiu que o Atlanta passasse a jogar nesta cidade, mas como o estádio da cidade de Ipiaú não atendia as exigências da FBF o Atlanta mandou seus jogos na cidade de Jequié, sede da equipe.
Campeão Baiano - 2ª Divisão: 1987
Estádio Waldomiro Borges
Capacidade 6.000
Após o rebaixamento o Atlanta disputou a 2ª Divisão até o ano de 1992, em 1993 abandonou o profissionalismo até 2000 quando retornou na 3ª Divisão sem conseguir bons resultados. Em 2008 apoiado pela empresa Doce Mel voltou ao futebol profissional na 2ª Divisão, mas devido a um tropeço no último jogo contra o Cruzeiro que era lanterna, estava eliminado e com dois atletas a menos em campo conseguiu chegar ao empate com o Atlanta com um gol no último minuto de jogo, ficou de fora da fase semi-final. Após um ano sabático o Atlanta retornou as atividades em 2010 para disputar a 2ª Divisão novamente com o apoio da Doce Mel da cidade de Ipiaú que exigiu que o Atlanta passasse a jogar nesta cidade, mas como o estádio da cidade de Ipiaú não atendia as exigências da FBF o Atlanta mandou seus jogos na cidade de Jequié, sede da equipe.
Estádio Waldomiro Borges
Capacidade 6.000